Thesis Markdown Aligner

Inputs

• 重构后的章节 Markdown
• codex_md/question_list.md

Outputs

• codex_md/00_thesis_outline.md
• codex_md/terminology_glossary.md
• codex_md/symbol_metric_table.md
• 证据缺口清单（可并入 missing_info.md 或单独文件）

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Always read:

• references/overview.md
• references/alignment_axes.md

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• assets/markdown_alignment_contract.json

Workflow

1. 统一主线与章节边界
2. 统一术语、缩写、符号、指标
3. 识别重复内容与应上移/下沉的内容
4. 标记尚未闭合的证据缺口

Key Rule

如果各章还不能共享同一套术语、符号和指标口径，就不要进入 tex-writeback。